秦朝(公元前221~207年)
关于秦朝
秦叔(秦始王)是首位统一中国的皇帝，他不但利用武力征服六国达到统一目标，还统合各地的制度如货币、文字、度量衡单位等，以提高统治及管理效率。
秦始王以严苛手段治国，引起贵族和学者们不满，并于公元前213年，发生了"焚书坑儒"的历史事件，秦始王把460位学者坑死又烧毁很多重要的历史文献，以警戒对抗他的人。
幸运地一些有关占卜、医学及农业书籍得以保全。最后秦朝因农民起义而灭亡，成立汉朝。与此同时，中医药体系，随同大量医疗实践的开展，内容开始充实及提高。
汉朝 (公元前206~公元220年)
* 西汉 公元前206 ~ 公元24年
* 东汉 公元25 ~ 220年
关于汉朝
刘邦于公元前206年成功推翻秦朝建立汉朝。当时边境外的游牧民族不断侵犯，于是西汉将这些部族征服，使中国的版图因而扩大，地域包括现今的蒙古、东北九省、朝鲜、中国南部、越南以及亚洲中部。
同时因为营商方便，中国西北方出现了"丝绸之路"，形成一条兴旺的东西方文化交流及经商的通道。公元9至23年，王莽，篡改西汉，成立新朝，新朝很快灭亡，之后进入东汉时期。
汉朝是一个在艺术、哲学及科技都有创新的时代。例如在公元2年张衡发明候风地动仪，是一种测量地震的仪器。而各方面的医学理论、体系亦初步形成了。
哲学及宗教的角色
哲学、社会价值观及宗教对中医药的发展影响深远。不同派系的哲学及宗教思潮包括佛教，由此时崛起，并开始广泛流传。此外因为纸张的发明，许多不同的书籍开始出现例如司马迁(公元前145 ~ 82年)的名著《史记》。
有更多医书出现了而且质量不断提升。当时儒家理性思想相当普及;很多学者或学校开始习究和记录医药文献，以实践自己的理念。中医药的实践开始注入哲学思想，例如道家的养生思想、儒家的行医规范等等。
道教及长生不老
由于封建统治者都梦想长生，享受人间的荣华富贵，搜求药材及炼丹的风气因而盛行起来。而当时的其他玄学如佛教也渗入了道教教义。
例如汉桓帝(公元147~168年)邀请一批与道教支派有关系的印度佛教高僧入宫，希望为他提供长生不老仙丹。此为中医药方剂学的起源。
医学教育的发展
师徒相授制度是东汉常见的培训医师方法。通常以家传形式进行，以确保稳定及可靠的收益。要成为名医则仍重经验，文献《曲礼》说：「医师的医术若非前三世所传下来的，最好不要服用他所处方的药」。
选拔学徒的过程非常严谨，就算《黄帝内经》内亦强调选拔的重要，因为徒弟的成功会为师傅带来荣誉。那时的人亦利用著名医籍来自我学习医术。