中国农业大学食品科学与营养工程学院江正强教授说，真正的全麦面包里含有大量麸皮，麸皮中的脂酸和草酸会影响钙离子的吸收，除此之外，对其他一些微量元素的吸收也有影响，比如镁、锌、亚铁离子等人体比较需要的微量元素。
对于全麦面包的食用，在西方也早有争论，西安营养学会秘书长王勇健说，相比东方人来说，在西方，面包是人们的主食，也曾有过偏爱白面包与偏爱全麦面包的争论，而目前大部分西方人则是两者都吃，不会偏爱一种。
专家指出，全麦面包不会破坏身体中的钙，但是会抢夺其他食物的钙，妨碍身体对钙质的吸收，比如吃全麦面包喝牛奶，那么牛奶中可能有一部分钙被抢夺走了，而没被身体吸收掉。
所以，对于缺钙的人群来说，最好不要把全麦面包当作主食。对于需要补钙的老人、小孩和更年期妇女，也最好别长期吃全麦面包。
此外，全麦面包中膳食纤维过于丰富，胃肠消化功能差的人尽量少吃。而对于身体健康的人群来说，吃吃全麦面包对身体还是很有好处的，可以抗氧化，更可以起到很好的减肥作用。但是也不能过分痴迷，天天早上都是全麦面包，就不太好了。
王勇健最后建议那些需要补钙的人，在挑选全麦面包时，尽量选麸皮含量少一点的，可以注意看一下包装上的食品成分配料表，如果麸皮排在成分表的第一位就不要买了，如果排在后面就可以考虑一下。