蘑菇的不同部位，营养物质的含量不同。一般地说，菌盖比菌柄营养更丰富，最适于食用的是新鲜的较幼嫩的蘑菇子实体。蘑菇不仅营养丰富，味道鲜美，富含人体必需的赖氨酸等，还含有丰富的矿质元素，例如蘑菇富含的微量元素硒，可使血中谷胱甘肽过氧化酶的活性增强，防止过氧化物损害机体，提高身体免疫力。蘑菇所含的大量植物纤维，具有防止便秘、促进排毒、预防糖尿病及大肠癌、降低胆固醇含量的作用，而且它又属于低热量食品，可以防止发胖，它还是一种较好的减肥美容食品。
香菇中维生素D的含量比大豆高20倍，是海带的8倍。而维生素D能帮助人体吸收钙，有益于骨骼的健康。维生素D天然来源不多，其中牛奶和某些鱼类含有维生素D，日光中的紫外线也可促使人的皮肤合成维生素D，所以蘑菇无疑是天然食物中维生素D的重要来源之一。
美国FDA的最新研究发现，用紫外线照射生长或刚采摘的新鲜蘑菇，能使蘑菇合成大量维生素D，并在美国食品和药物管理局科学论坛上报告了这一研究结果。研究人员用紫外线灯照射采摘下来的新鲜白色圆蘑5分钟，就产生了大量的维生素D，其含量相当于人体每日所需要的8.69倍。用紫外线照射生长中的蘑菇3个小时，其维生素D的含量也显著增加。这些实验证实蘑菇经日晒后可增加维生素D。其实蘑菇之所以有这样神奇的功效，是因为它含有维生素D产物前体——麦甾醇，这种物质在日光照射下会转化成维生素D。
研究进展提示我们，蘑菇对所有人群尤其是青少年、老年妇女等特别需要补钙的人群非常有益，而欲使其营养更丰富，将其营养价值发挥到极至，首先要选用新鲜蘑菇，而且最好将蘑菇在阳光下晒一段时间后再食用。人们在补钙的同时，增加维生素D的摄入能促进钙的吸收利用，因此，蘑菇带来的大量维生素D无疑是一个上佳的选择。