根据Seema Jain教授发表于NEJM上的的一项研究显示，感染社区获得性肺炎(CAP)的儿童中，感染病毒的可能性远远高于感染细菌(73% vs 15%)，并且5岁以下儿童更易感染病毒。
在3所儿童医院中，呼吸道合胞病毒(RSV)在28%的患者中发现，之后是人鼻病毒，见于27%的患者。
其它病原体包括人偏肺病毒(13%)，腺病毒(11%)，肺炎支原体(8%)，副流感病毒(7%)和流感病毒(7%)，冠状病毒(5%)，肺炎链球菌(4%)，金黄色葡萄球菌(1%)和化脓性链球菌(1%)。
值得注意的是，儿童因CAP入院的患者中近2/3是2岁以下儿童，儿童患病率为62.2/10000儿童(95% CI 57.6-67.1)。2-4岁儿童中此比例下降至23.8/10000儿童(95% CI 21.4-26.3)。总体而言，儿童因CAP入院比为15.7/10000儿童(95% CI 14.9-16.5)。
Jain及其同事指出，“病原体的低检出率可能是受细菌结核疫苗有效性和相关不敏感诊断检测的影响。”
作为社区获得新肺炎CDC病原学研究(EPIC)的一部分，儿童CAP的筛查是自2010年至2012年在以下三所医院进行的： 孟菲斯市的乐博纳尔儿童医院、 纳什维尔的梦露卡莱尔儿童医院、盐湖城的儿童医院。
上一周入院的儿童中，有免疫抑制或其它身体条件不合格的儿童被排除此研究。
怀疑儿童感染肺炎时，工作人员从91%的患者中获取血液样本，从96%的患者中获得鼻腔和口腔拭子，从4%的患者中获得胸腔积液，从1%的患者中获得气管抽吸物，从1%的患者中获得支气管灌洗标本，从44%的患者中获得双份血清标本，对100%的患者拍摄胸片。
无肺炎而入院的儿童患者被纳入对照组中。
接受筛查的127556例儿童中，2358例儿童X线证实为肺炎并纳入此研究。
肺炎患者的中位年龄为2岁(四分位距为1-6)。入组患者45%为女性，40%白种人，33%黑种人，19%为西班牙裔美国人。研究者强调，未成功纳入此研究的儿童是西班牙裔的可能性较低，并且住院时间较少。
哮喘或反应性气道疾病等潜在疾病可见于51%的入组儿童。
儿童的平均住院时间为3天(四分位距为2-5)，21%的儿童需重症监护。共有3例儿童死亡。
入院前的5天，有18%的儿童接受抗生素治疗。住院期间有88%的患者接受抗生素治疗。使用抗生素期间未采集患者生物样本。
Jain团队查看儿童疫苗接种记录，发现30%的儿童(≥6个月)此季节至少接受1次流感疫苗接种，87%的儿童(19个月-12岁)接受≥3次肺炎球菌结合疫苗的接种。
81%的患者体内检测出细菌或病毒病原体。在这些患者中，66%的患者感染一种或多种病毒，8%的患者感染一种或多种细菌，7%的患者感染细菌和病毒病原体。
5岁以下儿童较年长儿童感染 RSV、腺病毒、HMPV的可能性更高(37% vs 8%,15% vs 3%，15% vs 8%)。另外，5岁及以上儿童较年幼儿童感染肺炎支原体的可能性更高(19% vs 3%)。
作者指出，这些病原体往往具有季节性。RSV、流感、HMPV和肺炎球菌在冬季高发。RSV异常高发于2010年末/2011年初的冬季，整个研究年中，RSV的感染率高于任何其它可见病原体的2倍之多。
人鼻病毒感染率全年保持稳定。肺炎支原体感染率从夏季到秋季增加，在冬季达到高峰。整体而言，肺炎感染率在秋季和冬季最高。
调整年龄后，对照组中17%的儿童检测出人鼻病毒，但对照组中仅3%的儿童检测出了在患者组中检测到的其它病原体。
作者也指出了研究的局限性，包括未获得每例纳入者的所有样本类型，未纳入所有符合条件的儿童，菌性肺炎的诊断测试的灵敏性不完善，“便捷”的样本可能未能普遍反映全美国儿童。